Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGER3P43115 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms