Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms