Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT2P35908 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT2P35908 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT2P35908 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT2P35908 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms