Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDAP32320 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDAP32320 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDAP32320 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDAP32320 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms