Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms