Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB2P29033 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB2P29033 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms