Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms