Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HRCP23327 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HRCP23327 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HRCP23327 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HRCP23327 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HRCP23327 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms