Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms