Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms