Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms