Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms