Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD8BP10966 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD8BP10966 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8BP10966 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms