Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF1P10914 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF1P10914 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF1P10914 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms