Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL3P10147 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL3P10147 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL3P10147 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3P10147 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3P10147 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3P10147 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms