Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GLI4P10075 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GLI4P10075 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms