Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC166P0CW27 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms