Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms