Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA1P02647 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms