Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX58O95786 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms