Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC3O60481 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms