Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms