Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms