Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1D1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C1D1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H7C1D1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H7C1D1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H7C1D1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H7C1D1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms