Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms