Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L4A6NCW7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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