Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWA3AA6NCI4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms