Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms