Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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IGHV3-16A0A0C4DH30 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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