Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD54BQ9Y620 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms