Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms