Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMED5Q9Y3A6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms