Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms