Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms