Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHA12Q9UN75 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms