Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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