Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C4Q9UKN8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C4Q9UKN8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms