Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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