Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms