Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms