Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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