Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1BQ9UD71 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1BQ9UD71 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms