Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms