Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms