Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms