Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms