Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLAIN2Q9P270 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLAIN2Q9P270 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLAIN2Q9P270 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms