Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO1Q9P1Z2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CALCOCO1Q9P1Z2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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