Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms