Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms